Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms