Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F6O75461 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms