Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms