Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms