Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms