Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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