Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms