Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms