Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms