Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms