Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms