Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms