Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AKAP9Q99996 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms