Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms