Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms