Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms