Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00615Q96LM1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms