Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms