Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms