Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms