Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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