Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms