Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms