Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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