Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRIP1Q5VSL9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRIP1Q5VSL9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms