Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms