Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms