Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms