Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms