Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms