Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RPE65Q16518 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RPE65Q16518 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RPE65Q16518 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RPE65Q16518 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RPE65Q16518 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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RPE65Q16518 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RPE65Q16518 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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