Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms