Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms