Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM53BQ14153 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FAM53BQ14153 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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