Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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