Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms