Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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