Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms