Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms