Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3AQ13472 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TOP3AQ13472 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TOP3AQ13472 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms