Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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