Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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