Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms