Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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BNIP3Q12983 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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BNIP3Q12983 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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