Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXF1Q12946 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FOXF1Q12946 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FOXF1Q12946 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FOXF1Q12946 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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