Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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