Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
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