Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD47Q08722 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD47Q08722 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD47Q08722 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD47Q08722 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD47Q08722 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD47Q08722 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD47Q08722 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD47Q08722 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD47Q08722 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms