Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FMODQ06828 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FMODQ06828 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms