Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms